建设施工工程结算后，发包人欠付承包人工程款，承发包双方就偿还工程欠款签订“还款协议书”。那么，施工主合同约定的仲裁条款适用于因履行“还款协议书”发生的纠纷吗？
最高人民法院分认为：合同的仲裁条款具有独立性。《仲裁法》第19条第1款规定，仲裁协议独立存在，合同的变更、解除、终止或者无效，不影响仲裁条款的效力。上述法律规定充分体现了仲裁条款在民事合同中所具有的独立性。
工程结算后，施工合同双方对发包人欠付承包人工程价款数额达成一致，即工程欠款数额已成为一个定数。“还款协议”是为履行施工主合同签订的，体现了工程结算的结果，其性质为补充协议，是对施工主合同的补充、细化。
同时，“还款协议”是对从签订到结算前这一期间的履行行为作一了断，对后期确认欠款数额、还款时间、还款方式等内容作出约定；从“还款协议”文义内容看，主要内容更像是借款合同，发包人主要义务按约定还款，“还款协议”具有独立性。
基于上述原因，施工主合同约定的仲裁条款适用于因履行“还款协议”发生的纠纷案件。