在《民事诉讼法》对股东代表诉讼没有明文规定的情况下，应根据股东代表诉讼的特定确定管辖法院。一般认为，股东代表诉讼的实质原告是股东所在的公司，只是因为公司怠于或者拒绝提起诉讼而由股东代表公司提起诉讼。因此，在公司监事会、监事、董事会、执行董事等对公司负有违约或者侵权之债时，作为债权人的公司应当向哪个法院提起诉讼，股东代表诉讼中的原告就应向哪个法院提起诉讼。
这样既可以保持股东代表诉讼制度与民事诉讼法律体系之间的协调，又可以充分彰显股东代表诉讼中真正原告是公司的内涵。另外，在股东为追究董事责任而提起的诉讼，依据合同纠纷案件或者侵权纠纷案件的地域原则，可以由公司住所地人民法院管辖。